Ústredie je hlavnou administratívno-správnou jednotkou organizácie.
Ústredie zamestnáva profesionálnych pracovníkov (tajomníkov, projektových manažérov a podobne) a stará o administratívny chod organizácie, ekonomické otázky, PR stratégiu, koordináciu činnosti dobrovoľníkov a manažment celoslovenských a medzinárodných projektov, ako aj cezhraničnej spolupráce.
Aktuálni pracovníci Ústredia DO FÉNIX:
Mgr. Eva Pintérová – predsedníčka DO FÉNIX
Mgr. Patrik Herman – podpredseda DO FÉNIX
Mgr. Martina Barboríková – riaditeľka ústredia
Mgr. Katarína Kepenešová – projektová manažérka
Ing. Katarína Lučeničová – metodička
Ing. Ľudmila Móriková – ekonómka
Ing. Otília Sandtnerová – mzdová referentka